2020年3月27日至5月6日，昌吉市委派出4个巡察组，对市直机关工委、市项目代建局、市医疗保障局、市司法局、市编委办、市商务和工业信息化局、市老干局、市硫磺沟镇共青团社区和楼庄子村9个党组织开展常规巡察。6月5日，市委巡察组分别向被巡察党组织反馈了巡察情况，对巡察整改工作提出意见建议。巡察组发现的党员干部问题线索，已按有关规定移交市纪委监委和组织部等部门核查处理。巡察发现的主要问题现向社会公示。
市直机关工委：
学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想和党的十九大精神不扎实，真学真懂真用不足；政治敏锐性不强,对意识形态领域工作重视不够；主题教育学习流于形式；执行政府采购和财务制度不严，违规支付现象时有发生；落实全面从严治党主体责任有缺失，党建主体责任履行不到位。
项目代建局;
贯彻落实党的路线方针政策和党中央决策部署不力，理论武装重视不够；意识形态领域责任制落实不到位，分析研判流于形式；精神文明创建内涵不丰富，创建效果打折扣；履行项目代管、监管责任不到位；党风廉政建设责任制落实不实，廉政风险点把控不严，警示教育效果不佳;党组织领导弱化，党建基础薄弱；项目审计问题整改不彻底，反馈问题边改边犯。
司法局:
学习习近平新时代中国特色社会主义思想不深入，以新思想新精神指导司法行政工作不足，贯彻落实党的路线方针政策和中央重大决策部署有差距；落实全面从严治党主体责任不到位；落实新时代党的组织路线不够有力，抓党建主责主业意识不强，履行管党治党政治责任薄弱；对审计反映的问题和主题教育检视问题整改不彻底。
医疗保障局:
学习习近平新时代中国特色社会主义思想和党的十九大精神不扎实，对医疗保障政策学习研究不透，贯彻落实党的路线方针政策和中央重大决策部署有差距；落实全面从严治党主体责任不严，医保基金监管不到位，职能作用发挥不充分；践行新时代党的组织路线不够有力，党建基础工作薄弱，对主题教育发现问题整改不彻底。
市委编委办:
落实党中央重要决策部署责任不实，开展意识形态领域工作消极应付；职能作用发挥不充分，对机构编制执行情况日常监督存在短板，对“两项群众”工作监督落实不力；党的基层组织建设弱化，“三重一大”事项议事决策过程不清晰，开展党员民主评议走过场，党员队伍建设缺少规划；党风廉政建设主体责任意识不强，班子成员履行“一岗双责”不到位；对工作研究不深入，工作人员责任心不强。
商务和工业信息化局:
学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想和党的十九大精神浅尝辄止，中心组学习仅停留在读原文、传达文件，意识形态领域工作松懈；党组履职不充分，层层传导压力递减；优化营商环境履职不到位；对招商引资企业运行管理不够，合同执行力不强；落实脱贫攻坚工作责任不实，深化社会扶贫、带动脱贫效果不明显；党的基层组织建设薄弱，落实党风廉政建设主体责任不力；对审计建议重视不够，审后又犯；执行财经纪律不严，财务监管有缺位。
老干局:
党组织学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想不深入，落实党中央关于新时代老干部工作不到位；民主决策议事规则不严谨，核心作用发挥不明显；服务老干部工作有欠缺；落实党风廉政建设不力，党风廉政主体责任缺失, 廉政谈话不扎实; 财务管理不规范, 存在公车在非政府采购点维修等现象。
硫磺沟镇楼庄子村:
党组织政治思想引领不强，学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想不认真，意识形态领域教育抓得不实；核心作用发挥不充分，执行村级“四议两公开”工作机制不力，村集体“三资”管理不到位；党建引领经济发展意识不足，发展特色旅游服务业增收效果不明显；落实党风廉政建设“一岗双责”不到位；财务管理不规范，审核把关不严。
硫磺沟镇共青团社区:
党组织学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想不认真，不深入，成效不明显；抓党建主责主业意识不强，对党建工作缺乏研究；党风廉政建设主体责任缺失，廉政教育不扎实，廉政谈话图形式、走过场；社区固定资产未建立台账，存在管理漏洞和资产流失隐患。